Відокремлений структурний підрозділ  «Слов’янський фаховий коледж Національного авіаційного університету» (СФКНАУ), як навчальний заклад, діє з 1964 року. Згідно з розпорядженням Ради міністрів УРСР від 16.05.1964 р. № 595-р на базі Слов’янського механічного технікуму було створено Слов’янське авіаційне технічне училище ЦПФ, яке підпорядковувалось Міністерству цивільної авіації СРСР.

Відповідно до наказу Міністерства цивільної авіації СРСР від 29.01.1991 р. № 18 навчальний заклад отримав статус коледжу і мав назву – Слов’янський авіаційний технічний коледж цивільної авіації.

У 1991 році коледж підпорядкований Міністерству вищої освіти України (наказ мінвузу України від 26.11.1991 р. № 231).

З 1994 року Слов’янський коледж цивільної авіації увійшов до складу Київського міжнародного університету цивільної авіації (нині Національний авіаційний університет) з правом юридичної особи (наказ Міністерства України від 18.05.1994 р. № 147).

З 2002 року коледж мав назву – Слов’янський коледж Національного авіаційного університету (наказ ректора НАУ від 04.06.2002 р. № 84 ОД).

Навчальний заклад заснований на загально – державній формі власності (свідоцтво про державну реєстрацію від 04.06.2002 р. № 328295) і внесений Державним комітетом статистики України до Єдиного державного реєстру підприємств і організацій України (довідка від 09.12.2003 р. № 755430).

Наказом Міністерства освіти і науки України від 19.04.2007 р. №314 припинена юридична особа коледжу і з 1 грудня 2009 року коледж є відокремленим структурним підрозділом НАУ.

Положення про ВСП НАУ Слов'янський коледж НАУ затверджено ректором НАУ у 2009 році.

За наказом Міністерства освіти і науки України від 28 травня 2020 року № 712 коледж перейменовано у Відокремлений структурний підрозділ «Слов’янський фаховий коледж Національного авіаційного університету».

Положення про Відокремлений структурний підрозділ «Слов’янський фаховий коледж Національного авіаційного університету» затверджено та введено в дію вченою радою університету від 04.06.2020 року № 191/ОД.

За наказом Міністерства освіти і науки України від 29 квітня 2022 року коледж тимчасово переміщений на базу Льотної академій Національного авіаційного університету, м. Кропивницький,  Кіровоградська обл. до завершення воєнного стану.